De Europese Commissie opent een grondig onderzoek naar de beslissing van het Havenbedrijf Antwerpen van 26 maart 2013, dit naar aanleiding van een klacht van Katoen Natie. Het Havenbedrijf besliste toen om voor alle concessionarissen met wie tonnenmaatverplichtingen waren afgesproken, rekening te houden met de onvoorziene omstandigheden ingevolge de financieel-economische crisis van 2008-2009. Dat leverde Antwerp Gateway en PSA aanzienlijk lagere boetes op dan voorzien.

Deze beslissing vormde voor Katoen Natie, dat zelf van een vermindering van de tonnenmaatverplichting had kunnen genieten, de aanleiding om verschillende procedures aan te spannen bij diverse rechtbanken en hoven evenals bij de Raad van State. Tot op heden werden al deze vorderingen afgewezen. In een vonnis ten gronde verwierp de Rechtbank van Eerste Aanleg op 12 februari 2015 de vorderingen van Katoen Natie over de hele lijn. De rechtbank oordeelde dat niet werd aangetoond dat aan PSA en Antwerp Gateway enige staatssteun werd toegekend. Het beroep dat door Katoen Natie tegen voormeld vonnis werd aangetekend, is momenteel hangende bij het Hof van Beroep te Brussel.

Parallel werd door Katoen Natie in 2013 ook een klacht ingediend bij de Europese Commissie wegens miskenning van de staatssteunregelgeving. Naar aanleiding van de klacht, stelt de Europese Commissie thans een staatssteunonderzoek in naar de toenmalige beslissing van het Havenbedrijf Antwerpen.