De Haven van Brussel heeft als eerste Belgische haven het label "CO2-neutrale onderneming" in ontvangst mogen nemen. Het label heeft betrekking op alle voertuigen van de haven en op alle gebouwen waarin er personeel werkzaam is, namelijk de maatschappelijke zetel op het Redersplein, de kapiteinsdienst in de voorhaven, de mobiele Buda- en Godshuizenbrug en de sluizen van Molenbeek en Anderlecht.

De Haven van Brussel nam verschillende maatregelen om de CO2-uitstoot tot het minimum te beperken. Zo werden er zonnepanelen geïnstalleerd, isolatiewerken uitgevoerd en het wagenpark verkleind en gemoderniseerd met de aankoop van elektrische en hybride voertuigen.

De restuitstoot werd gecompenseerd dankzij het "Paradigm Project Kenya". Dat programma wil de gezondheid en de inkomens in Kenia verbeteren door minder brandstof aan te kopen voor keukens van gezinnen en overheden en door de lokale bevolking makkelijker toegang te bieden tot water. Het project maakt gebruik van koolstoffinanciering om lokale marktkanalen te ontwikkelen en ngo's te ondersteunen bij het creëren van duurzame distributienetwerken, verbeterde kookfornuizen en aangepaste waterzuiveringssystemen.